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应用表达谱芯片研究胶质母细胞瘤相关基因的表达及功能

Expression and function of differentially expressed genes in glioblastoma by using cDNA microarray

摘要:

目的:应用基因表达谱芯片筛选研究人脑胶质母细胞瘤发生,发展中相关基因的表达及生物信息分析功能.方法:采用含13 939条基因(设置173个对照点)的BioStarH140S型表达谱芯片;用改良的"一步法"抽提2例正常脑及6例胶质母细胞瘤组织总RNA,制备杂交探针;杂交芯片后用ScanArray4000扫描芯片荧光信号,提取正常脑及胶质母细胞瘤组织差异基因;对差异基因进行生物信息分析,初步分类及Northern杂交研究.结果:按照差异显著标准,在胶质母细胞瘤中共有198条(1.42%)基因表达差异显著,其中77条(0.55%)表达上调,121条(0.87%)表达下调,55条新基因尚未在GenBank登录;生物信息分析发现肿瘤相关基因与细胞信号和传递蛋白、代谢、蛋白翻译合成、细胞骨架和运动、免疫、原癌基因和抑癌基因、细胞周期、细胞凋亡等9类基因密切相关;Northern杂交结果与表达谱芯片一致.结论:基因表达谱芯片可低成本、高通量、高效率筛选胶质瘤相关基因,并为基因群功能研究提供了方向;本研究结果有助于揭示胶质母细胞瘤分子机制,为指导肿瘤的临床诊断、治疗和预后判断提供依据.

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作者: 陈菊祥 [1] 卢亦成 [1] 骆纯 [1] 胡国汉 [1] 楼美清 [1] 吴小军 [1] 李瑶 [2] 应康 [2]
期刊: 《第二军医大学学报》2004年25卷5期 498-502页 ISTICPKUCSCDEMBase
分类号: R730.264
栏目名称: 论著
DOI: 10.3321/j.issn:0258-879X.2004.05.009
发布时间: 2004-07-31
基金项目:
上海市自然科学基金 the Major Basic Research Foundation of Shanghai Science,Technology Committee
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