换一批TYMP基因在肾透明细胞癌中的表达及临床意义
Expression and clinical significance of TYMP in clear cell renal cell carcinoma
摘要目的:阐述胸苷磷酸化酶(thymidine phosphorylase,TYMP)基因在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,CCRCC)中的表达及临床意义.方法:利用Oncomine及GEPIA数据库分析TYMP基因在正常肾组织及CCRCC组织中的表达差异;通过GEPIA数据库进行TYMP基因表达程度与病理分期的相关性分析;利用OncoLnc数据库对TYMP基因的表达水平与CCRCC患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和log-rank检验;经MethHC数据库分析CCRCC组织和正常肾组织中TYMP启动子区DNA甲基化水平的差异;利用String-DB数据库分析与TYMP蛋白相互作用的蛋白;最后通过The Human Protein Atlas数据库分析TYMP蛋白在正常肾组织及CCRCC组织中的表达差异.结果:在mRNA及蛋白水平上,TYMP在CCRCC组织较正常肾组织中显著高表达,且TYMP mRNA表达水平越高,CCRCC病理分期越高;与TYMP基因低表达组相比,TYMP基因高表达的CCRCC患者总体生存率明显降低;CCRCC组织中TYMP启动子区DNA甲基化水平较正常组织甲基化水平显著降低;同时,与TYMP蛋白相关的蛋白有TK2,NT5M,CDA,UPRT,NT5C,UPP2,UMPS,TK1,UPP1和DPYD等,主要参与嘧啶核苷的合成、分解、代谢,转移戊糖基、蛋白质同源聚合等生物过程.结论:大样本数据挖掘能迅速获取CCRCC组织中TYMP基因表达的相关信息,为深入研究TYMP基因在CCRCC发生发展中的作用机制及预后奠定基础.
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