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广西金秀瑶族D3S1358等6个STR基因座遗传多态性研究

Genetic polymorphisms of 6 STR loci in Jinxiu Yao ethnic group of Guangxi Province

摘要:

目的 了解广西金秀瑶族6个STR基因座(D3S1358、D5S818、S7S820、D13S317、FGA、vWA)的遗传多态性,探讨该民族与广西融水苗族等12个民族群体遗传关系.方法 枸橼酸钠抗凝的广西金秀瑶族无相关健康个体血样175例,先用Chelex100方法提取DNA,然后用AmpFeSTR(R)IdentifilerTMkit荧光标记复合PCR扩增技术进行6个STR基因座复合扩增,用ABI3100型遗传分析仪对扩增产物进行电泳,并用GeneScan Analysis 3.7和Genetyper 3.7软件对扩增结果进行分析.利用D3S1358等6个STR基因座的基因频率计算广西金秀瑶族与广西融水苗族等12个民族群体间的遗传距离,并通过MEGA3.1软件的NeighborJoining方法构建系统发生树.结果 广西金秀瑶族6个位点中检测出52种等位基因,基因频率分布在0.002 9~0.394 3之间;6个STR基因座的杂合度分布在0.737 1~0.868 6之间,个体识别力(DP)分布在0.875 3~0.960 1之间,累积个体识别力TDP为>0.999 999 711,非父排除率(EP)在0.604 6~0.851 9之间,累积非父排除率CEP为0.999 556 633,多态信息量PIC分布在0.678 8~0.842 8之间.广西金秀瑶族等13个群体的系统发生树结果:广西金秀瑶族先跟广东瑶族和广西融水苗族相聚,然后与广西水族、广西汉族、广西京族、广西仫佬族、广西毛南族、广西临桂瑶族和广西三江侗族相聚,接着先后与广西崇左壮族、广东汉族相聚,最后与蒙古族相聚.结论 广西金秀瑶族群体D3S1358等6个STR基因座均属于高度多态性遗传标记;广西金秀瑶族可能是以瑶族的遗传标记为主的多族源群体.

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作者: 李松峰 [1] 徐林 [1] 龚继春 [1] 周丽宁 [1] 邓琼英 [1] 罗国容 [1]
期刊: 《广西医学》2006年28卷11期 1683-1686页 ISTIC
分类号: Q3
栏目名称: 论著
DOI: 10.3969/j.issn.0253-4304.2006.11.001
发布时间: 2006-12-05
基金项目:
国家自然科学基金
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