生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因初探-论文-万方医学网

生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因初探

Key Genes in Breast Cancer Based on Bioinformatics Pipeline

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摘要：

目的寻找具有诊断或靶向治疗作用的乳腺癌关键基因.方法通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)中已明确的乳腺癌相关数据集,运用生物信息学中的基因组富集分析(GSEA)初步筛选,并富集出相应的通路;在此基础上继续用Meta分析方法筛选出乳腺癌的关键基因.结果根据GSEA和Meta分析出差异基因22个,再与NCBI数据中与乳腺癌相关的基因的结构、功能比较,得出TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12为关键基因.结论 TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12等基因与乳腺癌细胞周期、分化和凋亡有密切关系,可进一步研究以期作为乳腺癌诊断和靶向治疗的基因.

作者：朱非白 ^[1] 朱萧 ^[1] 韦长元 ^[2] 覃庆洪 ^[2] 练斌 ^[2]

作者单位：广西医科大学研究生学院,南宁市,530021 ^[1] 广西医科大学附属肿瘤医院,南宁市,530021 ^[2]

期刊：《广西医学》2013年35卷1期 22-24页 ISTIC

关键词：乳腺癌生物信息学基因组富集 Meta分析关键基因

主题词：基因(Genes)乳腺肿瘤(Breast Neoplasms)计算生物学(Computational Biology)方法(Methods)基因组(Genome)

分类号： R737.9 Q781

栏目名称：论著

DOI： 10.11675/j.issn.0253-4304.2013.01.07

发布时间： 2013-03-27

基金项目：

广西医疗卫生科研课题

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被引：1
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