沼气池污泥微生物总DNA提取方法的比较-论文-万方医学网

沼气池污泥微生物总DNA提取方法的比较

Comparison of Three Protocols for Total DNA Extraction of Microorganism in Biogas Digesters

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摘要：

沼气发酵系统是一个复杂的生态系统,其污泥微生物超过99％是不可培养的.为了优化沼气池纤维素的转化效率、沼气的产率和开展污泥微生物多样性研究,本研究采用化学裂解法、溶菌酶裂解法和QIAamp DNA Stool Mini Kit提取了沼气池污泥样品中微生物的总DNA,对三种方法的DNA得率、纯度、大片段提取效果以及是否含有PCR反应抑制剂进行了研究,最后对16S rRNA基因V3区的扩增产物进行了PCR变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析.与化学裂解法和QIAamp DNA Stool Mini Kit法相比,溶菌酶裂解法得到的DNA量大、片段长、片段分布广、PCR扩增效率高；同时PCR-DGGE图谱显示,溶菌酶裂解法可更好地展示沼气池污泥中微生物的多样性.该结果为进一步提高沼气池中纤维素的转化效率和沼气生产优势菌种的质和量打下了一定的前期基础.

作者：张琳 ^[1] 熊格生 ^[2] 吴莎莎 ^[3] 卢向阳 ^[3] 吴俊文 ^[1] 许凤 ^[1] 颜亨梅 ^[1] 刘如石 ^[1]

作者单位：湖南师范大学生命科学学院,湖南长沙,410081 ^[1] 湖南农业大学科学技术师范学院,湖南长沙,410128 ^[2] 湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙,410128 ^[3]

期刊：《激光生物学报》2011年20卷6期 847-852,封3页 ISTIC

关键词：沼气池污泥总DNA提取 PCR-DGGE 微生物多样性

主题词：污水(Sewage)性(Sex)方法(Methods)效率(Efficiency)研究(Research)

分类号： Q78

栏目名称： 技术研究

DOI： 10.3969/j.issn.1007-7146.2011.06.026

发布时间： 2012-03-19

基金项目：

国家自然科学基金 中国博士后科学基金特别资助项目 科技部国际科技合作项目 国家"十五"科技支撑计划 长沙市科技计划项目 湖南省政府农办农科教科研计划项目

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被引：8
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