换一批
换一批子痫前期相关miR-23b-5p靶基因的预测及生物信息学分析
Predication and Bioinformatics Analysis of Preeclampsia-Related miRNA-23b-5p Target Genes
摘要：
目的 预测并对子痫前期相关miR-23b-5p的候选靶基因进行生物信息学分析,为miR-23b-5p的机制研究及其靶基因的实验验证提供理论基础.方法 在公共基因芯片数据库GEO(Gene Expression Omnibus)中选择子痫前期胎盘脐血miRNA差异表达的数据集GSE119799,选择表达显著下调的miR-23b-5p作为研究对象;使用在线分析网站RNA22-HAS、TargetScan及miRDB分别预测miR-23b-5p的靶基因,并利用韦恩图取其交集.使用富集分析网站DAVID对其交集靶基因进行GO功能富集分析、KEGG信号通路富集分析,并利用STRING网站对其进行蛋白质互作分析.结果 获得的222个交集靶基因在生物过程上主要涉及干细胞分化的调控、胞质翻译负性调节等;在细胞组成上主要涉及膜外成分等;在分子功能上主要涉及翻译调节活性、金属离子结合等,主要参与MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路及钙信号通路等.蛋白互作分析显示TLR4是链接度最高的关键基因.结论 miR-23b-5p可能通过影响滋养细胞侵袭、内皮细胞凋亡及炎症免疫反应等来参与子痫前期的发生发展,本研究为后续的靶基因验证及子痫前期发病机制的研究提供了理论基础和研究思路.
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作者：
作者单位：
安徽医科大学附属妇幼保健院妇产科,合肥 230001
[1]
期刊：
《南昌大学学报（医学版）》2021年61卷4期 1-6页
ISTIC
栏目名称：
基础医学
DOI：
10.13764/j.cnki.ncdm.2021.04.001
发布时间：
2021-09-26
基金项目：
安徽省科技创新项目示范类项目
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