换一批
换一批肺腺癌中免疫相关lncRNA的筛查表达与预后分析
Screening of Immune-Related lncRNAs and Analysis of Their Expression and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
摘要：
目的 筛查肺腺癌免疫相关lncRNA,并分析其在肺腺癌中的表达及对患者预后的影响.方法 自美国TCGA数据库筛选肺腺癌患者的转录数据和临床资料;使用美国Cytoscape软件3.5.0构建免疫-lncRNA共表达网络获得免疫相关的lncRNA;采用单变量Cox回归分析分配风险评分,筛选预后相关的lncRNA,GraphPad Prism 8软件进行Kaplan-Meier生存分析,多变量Cox回归分析预测患者生存的独立预后因素;使用R3.6.1软件和limma包进行主成分分析;基因组富集分析各组的功能注释.结果 数据库挖掘获得14142个lncRNA和331个免疫相关基因,关联分析共筛选出1133个免疫相关的lncRNA;单因素COX回归分析发现15个免疫相关lncRNA与肺腺癌预后相关,多因素Cox回归分析发现其中6个免疫相关的lncRNA(AL161431.1、AC079949.2、LINC00707、AC010980.2、AC068338.3、AC123595.1)是肺腺癌患者生存的独立预后因素,而风险分数是与总生存期相关的独立预后因素;6个免疫相关的lncRNA中低风险组总体生存期较高风险组显著延长(P<0.0001);主成分分析显示,高、低风险组的风险值有显著差异;基因富集分析结果显示高、低风险组在免疫应答通路中均有富集.结论 成功筛选出6个免疫相关的lncRNA,且其可预测肺腺癌患者的预后.
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作者：
作者单位：
南昌大学第二附属医院肿瘤科,南昌 330006
[1]
期刊：
《南昌大学学报（医学版）》2021年61卷4期 11-17页
ISTIC
关键词：
肺腺癌免疫相关lncRNA标志物预后
栏目名称：
基础医学
DOI：
10.13764/j.cnki.ncdm.2021.04.003
发布时间：
2021-09-26
基金项目：
江西省杰出青年基金项目
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