换一批基于焦亡相关lncRNAs的肺鳞癌预后风险模型
Prognostic Risk Model of Lung Squamous Cell Carcinoma Based on Pyroptosis Related-lncRNAs
摘要目的 探讨焦亡相关的长链非编码RNA(lncRNAs)在肺鳞癌(LUSC)中的预后价值,构建基于焦亡相关lncRNAs的预后风险评估模型.方法 从TCGA数据库获取LUSC患者的临床资料和RNA转录组数据,筛选在LUSC患者中差异表达的lncRNAs,将这些lncRNAs与焦亡基因进行Pearson相关分析以获得差异表达的焦亡相关lncRNAs.通过Cox回归分析构建焦亡相关的lncRNAs预后风险模型,将患者分为高、低风险组,使用Kaplan-Meier生存分析和ROC曲线评估模型的准确性.通过KEGG分析高、低风险组差异基因的富集情况.结果 Pearson相关分析发现743个焦亡相关的lncRNAs,并鉴定出277个焦亡相关的差异lncRNAs.单因素Cox回归分析显示21个焦亡相关的lncRNAs与LUSC患者的预后相关,进一步多因素Cox回归分析获得8个与焦亡及预后相关的lncRNAs,分别为PICART1、MIR3945HG、LINC01322、AC010422.4、AC112722.1、AL122125.1、AC104248.1、SFTA1P.生存分析显示高风险组预后较差,总体生存期显著低于低风险组(P<0.001).单因素和多因素Cox分析表明风险评分可以作为独立预后因子.另外,高、低风险组在通路富集、免疫细胞浸润、免疫检查点和m6A相关基因方面存在差异.结论 通过生物信息学方法筛选出的8个焦亡相关lncRNAs与LUSC预后相关,构建的预后风险评估模型具有一定的使用价值.
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栏目名称
DOI
10.13764/j.cnki.ncdm.2022.06.006
发布时间
2023-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81570012）
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