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马氏珠母贝TRAF7基因cDNA的克隆及表达分析

Clone and Expression Analysis of TRAF7 (Tumor Necrosis Factor Receptor-associated Factor 7) Gene cDNA from Pinctada martensii

摘要肿瘤坏死因子受体相关因子7 (TRAF7)属于TRAFs家族,参与多种免疫炎症反应.为了研究马氏珠母贝TRAF7 (PmTRAF7)的生物学功能,本研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得PmTRAF7基因cDNA的全长序列并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR (RT-PCR)技术检测了马氏珠母贝不同组织中PmTRAF7基因mRNA的表达.结果显示,PmTRAF7基因cDNA全长2 246 bp,开放阅读框(ORF)1 809 bp,编码602个氨基酸,5'非翻译区(5' UTR)长211 bp,3'非翻译区(3'UTR)长226 bp,预测分子量约为67.50kD,理论等电点为6.56.多序列比对结果发现软体动物间TRAF7具有高保守性.软件分析结果显示PmTRAF7的氨基酸序列具有典型的RING结构、锌指结构和7个重复的WD40序列.荧光定量数据分析表明,PmTRA F7基因在全组织中均有表达,在肝胰腺中表达量最高,外套膜和鳃中表达量也较高.

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DOI 10.13417/j.gab.035.000079
发布时间 2016-04-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(31472306) 广东省科技计划(2012A031100010) 湛江市科技计划(2013A03022)
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基因组学与应用生物学

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