换一批摘要为了研究yeA基因在竹黄菌中的调节机制,利用RT-PCR (reverse transcriptase-PCR)、RACE (rapid amplification of cDNA ends)及染色体步移技术克隆获得了veA基因的全长序列.序列分析显示:该基因序列全长为1 780bp,其开放阅读框长度为1 104 bp,编码367个氨基酸;其编码的蛋白质分子量为40.887 5kD,理论等电点pI为8.95,含42个负电荷氨基酸和46个正电荷氨基酸,是一种弱酸性蛋白;序列同源性分析结果显示:该基因编码的蛋白序列与偃麦草核腔菌(Pyrenophora tritici-repentis)的yeA蛋白序列(XM_001933944.1)及异旋孢腔菌(Cochliobolus heterostrophus)的velvet-like protein (JF826791.1)的同源性最高,其identity分别为78％和79％;对该基因编码的蛋白质进行二级结构预测,结果显示:该蛋白α-螺旋(alpha helix)占11.72％,延伸链(extended strand)占24.52％,β-转角(beta turn)占9.54％,无规卷曲(random coil)占54.22％;对其保守结构域分析显示,该蛋白含有一个Velvet superfamily结构域;利用同源模建方法预测其三级结构,结果显示该蛋白的三级结构模型与隔孢腔菌目中其他物种的veA异源二聚体的相似性为46％.
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栏目名称
DOI
10.13417/j.gab.036.003760
发布时间
2017-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（NSFC31460199）
贵州省科技合作计划项目
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