换一批从福尔马林固定-石蜡包埋样本中抽提RNA的方法与可行性
Study of method and feasibility for extracting RNA from formalin-fixed paraffin-embedded samples
摘要目的 探讨从福尔马林固定-石蜡包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)组织中抽提RNA的可行性和有效性.方法 收集胃癌和癌旁FFPE样本各41例,10 μm厚连续切片3张,采用蛋白酶消化盐析法抽提纯化RNA,检测提取RNA的产量和质量并分析其应用价值.结果 41对胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度为1.578 ～3.175,平均2.022 ±0.190,其中癌组织为1.578 ～3.175,平均2.033±0.240,癌旁组织为1.726 ～2.329,平均2.011±0.123;RNA浓度为(26.8 ～1 087) ng/μl,平均(267.062±210.435) ng/μl,其中癌组织为(50.5 ～1 087) ng/μl,平均(336.5±228.927) ng/μl,癌旁组织为(26.8～820) ng/μl,平均(197.62±165.47) ng/μl;琼脂糖凝胶电泳条带弥散分布,约300bp;胃癌和癌旁RNA的纯度比较P=0.564,尚不能认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA纯度有不同,但浓度比较P=0.001,可认为胃癌和癌旁FFPE样本中抽提的RNA浓度有所不同,癌组织中较高.结论 从FFPE样本中抽提的RNA在不可避免地出现降解的情况下仍然具有很高的纯度和合适的浓度；在确保扩增产物大小处于一定范围内的前提下从FFPE样本中抽提的RNA具有可以满足下游应用的纯度、浓度和完整性；建立从FFPE样本中抽提RNA的方法在各种影响因素符合要求后完全可行.
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分类号
R331（人体生理学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1001-7399.2013.03.018
发布时间
2013-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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