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子宫颈鳞状细胞癌差异表达miRNA的筛选及靶基因预测

Screening of differential expression microRNAs and forecasting of revelant target genes in human cervical carcinoma

摘要目的 筛选子宫颈癌相关microRNAs(miRNA)并对选出的miRNA进行靶基因预测.方法 应用基因芯片技术检测子宫颈癌组织及其癌旁组织1 891个miRNAs的表达,采用RT-PCR法验证miRNAs芯片结果的可靠性.应用软件对筛选出差异显著性表达miRNA的靶基因进行预测.结果 相对于癌旁组织,筛选获得 27个子宫颈癌异常表达miRNAs,其中表达上调超过1.5倍miRNAs有3个(hsa-miR-891a、hsa-miR-937、hsa-miR-F114);表达下调超过1.5倍的miRNAs有24个(hsa-miR-126、hsa-miR125a-5p、hsa-miR-26a、hsa-let-7c等).经RT-PCR检测证实其中hsa-miR-126和hsa-miR-26a表达明显下调,与基因芯片检测结果一致,hsa-miR125a-5p表达无明显下调.通过miRNA靶基因预测工具分析发现,miR-126有几百个靶基因.结论 筛选获得子宫颈癌相关miRNA差异表达谱,其中hsa-miR-126和hsa-miR-26a可能与子宫颈癌的发生、发展有关.

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DOI 10.3969/j.issn.1001-7399.2013.09.011
发布时间 2013-10-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
深圳市科技计划((200802158))
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