换一批表达谱基因芯片筛选结直肠癌转移中Tiam1相关基因
Screening of Tiam1-related genes contributing to metastasis of colorectal cancer using a gene expression profiling chip
摘要目的：筛选在结直肠癌远处转移中T细胞淋巴瘤侵袭转移1(T-cell lymphoma invasion and metastasis 1, Tiam1)相关基因并鉴定其表达。方法腹腔注射二甲基肼( dimethylhydrazine, DMH)建立小鼠结直肠癌模型,收集Tiam1转基因小鼠和野生型小鼠的结直肠癌原发灶新鲜组织5对,应用Affymetrix小鼠全基因组表达谱芯片检测两组的差异表达基因,qRT-PCR技术验证部分差异基因以确定结果的可靠性。结果基因芯片检测结果显示差异在3倍以上的基因共794个,有远处转移的Ti-am1转基因小鼠结直肠癌组织中表达上调的基因共400个,下调基因共394个；通过生物信息学分析及GENEMANIA共表达网络构建,筛选3个(PIK3R5、FIGF、RPS6KA6)特异相关的差异基因进行qRT-PCR技术验证,验证结果与基因芯片结果检测相符。结论通过基因芯片技术筛选和鉴定结直肠癌转移中Tiam1相关基因,建立了特异性结直肠癌转移表达谱,为寻找结直肠癌远处转移的分子标志物提供依据。
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关键词
结直肠肿瘤癌转移Tiam1基因芯片PI3K/AKT/mTOR信号通路colorectal neoplasmcancer metastasisTiam1gene chipPI3K/AKT/mTOR signaling pathway
分类号
R735.3（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.13315/j.cnki.cjcep.2015.04.002
发布时间
2015-06-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81472319）
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