换一批结直肠腺癌组织中USP10的表达及生物信息学分析
Expression of USP10 in colorectal adenocarcinoma and analysis of bioinformatics
摘要目的 探讨泛素特异性蛋白酶10(Ubiquitin-specific protease 10,USP10)及其mRNA在人结直肠腺癌组织中的表达及意义,并分析表达失调的原因.方法 选取99例人结直肠腺癌及83例正常肠黏膜组织,采用组织芯片和免疫组化法检测USP10蛋白表达,并分析该蛋白表达与临床病理特征及患者预后生存的关系.采用GEO数据库分析USP10 mRNA表达水平.通过生物信息学法筛选出负性调控USP10蛋白表达的miRNA.采用免疫印迹及实时荧光定量PCR法分别检测不同肠癌细胞系中USP10蛋白和miR-149的表达.结果 USP10蛋白在正常肠黏膜组织中的阳性率为71.08％(59/83),明显高于肠腺癌组织(53.54％,53/99)(P=0.015).USP10蛋白表达与结直肠腺癌临床病理特征及患者预后生存无相关性(P＞0.05).USP10 mRNA在结直肠腺癌中的表达水平是正常肠黏膜组织的1.07 ～1.45倍,表明USP10蛋白表达下调发生在转录后水平.生物信息学分析显示,结直肠腺癌组织中呈高水平表达的miR-149与USP10 mRNA的3'UTR端具有高度保守的潜在结合位点,且肠癌细胞系中miR-149与USP10蛋白表达呈负相关.结论 USP10蛋白低水平表达与结直肠腺癌的发生密切相关,其表达下调主要发生在转录后水平,miR-149高水平表达可能是负性调控USP10蛋白表达的因子之一.
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关键词
结直肠肿瘤结直肠腺癌USP10miR-149生物信息学colorectal neoplasmscolorectal adenocarcinomaUSP10miR-149bioinformatics
分类号
R735.3（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.13315/j.cnki.cjcep.2017.10.001
发布时间
2018-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81602535）
湖北省自然科学基金面上项目（2016CFB249）
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