新鲜冷冻和福尔马林固定石蜡包埋胃黏液腺癌组织中miRNA表达谱的比较

Comparison of the miRNA expression profiles in fresh frozen and formalin-fixed paraffin embedded gastric mucinous carcinoma

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摘要目的通过miRNA芯片对比分析新鲜冷冻与福尔马林固定石蜡包埋的胃黏液腺癌组织中miRNAs的表达谱,初步探讨大量存档且有完整病理资料的福尔马林固定石蜡包埋样本能否很好的应用于miRNA的表达分析.方法选取6例2017年术前未行放、化疗的胃黏液腺癌患者手术切除同一组织的新鲜冷冻标本和福尔马林固定石蜡包埋样本,进行镜下形态学观察并提取总RNA、质检,然后芯片杂交、信号扫描、数据转换后进行对比、相关性及表达谱的主成分分析.结果新鲜冷冻标本中提取的总RNA质量相对较高,保存度比较完整,从福尔马林固定石蜡包埋组中提取的总RNA有不同程度的降解.芯片杂交后统计结果显示两组样本中miRNA的表达谱差异有显著性,以fold_change(差异倍数log2)的绝对值≥2为标准,分别有76个(P＜0.05)和14个(P ＜0.01) miRNA呈差异表达,但配对标本之间均有较好的相关性.结论配对的新鲜冷冻与福尔马林固定石蜡包埋的胃黏液腺癌组织中miRNAs的表达谱差异有显著性,所以用福尔马林固定石蜡包埋组织分析miRNA基因的绝对表达值,结果可能不准确,能否反映全部miRNA基因的相对表达也需进一步的实验去证实.