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PCR为基础的反向线点杂交及16S~23S rDNA间区测序分析5种少见类型奴卡菌

Reverse line blot hybridization and DNA sequencing studies of the 16S ~ 23S rDNA gene internal transcribed spacer regions of five emerging pathogenic Nocardia species

摘要:

探讨5种新出现的奴卡菌种16S~23S rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA基因序列的多态性,筛查特异的奴卡菌种逆向线点杂交(reverse line blot,RLB)探针.方法对6例奴卡菌标本进行ITS基因扩增、克隆、测序,设计奴卡菌种特异探针及ITS间区rDNA基因特异的探针,进行以PCR为基础的RLB(PCR/RLB)杂交试验,不同的RLB型进行ITS基因测序分析,以鉴别不同的奴卡菌种及种内分型.结果发现2个Nocardia beijingensis菌株ITS间区有8个基因序列型,4个RLB型;N.thailandica有4个基因序列型及RLB型;N.blacklockiae有5个基因序列型,3个RLB型,其中N-bla RLBⅢ型与所有Nbla-ITS探针杂交没有信号;N.elegans有5个基因序列型,3个RLB型;N.vinacea有5个基因序列型,2个RLB型.结论通过PCR/RLB试验,准确的ITS基因测序认识了新出现的菌种,即N.beijingensis,N.blacklockiae,N.elegans,N.thailandica及N.vinacea.同时建立了可以大量筛查奴卡菌种的PCR/RLB方法,以进行快速临床诊断及流行病学研究.

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作者: 王晓彦 [1] 孔繁荣 [2] 连石 [3]
作者单位: 内蒙古医学院附属医院皮肤性病科,呼和浩特,010050 [1] 澳大利亚悉尼大学 Westmead医院微生物与感染中心,悉尼 NSW2145 [2] 首都医科大学宣武医院皮肤性病科,北京,100053 [3]
期刊: 《首都医科大学学报》2011年32卷4期 469-475页 ISTICPKU
分类号: Q78
栏目名称: 皮肤病与性病学专题
DOI: 10.3969/j.issn.1006-7795.2011.04.007
发布时间: 2011-12-06
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