换一批
换一批利用RNA-Seq技术鉴定拟南芥不定芽再生相关的转录因子
Identifying transcription factors involved in Arabidopsis adventious shoot regeneration by RNA-Seq technology
摘要：
转录调控是不定芽再生过程的主要调控方式之一,但具体机制尚需进一步研究.为此,利用基于IlluminaHiSeqTM 2000测序平台的RNA-Seq技术分析了不定芽再生缺陷突变体be1-3和野生型WS在愈伤形成和不定芽再生过程以及野生型WS从脱分化向再分化转变过程差异表达的转录因子(Transcription factor,TF)编码基因.结果表明:与野生型WS相比,be1-3在脱分化过程差异表达的TF编码基因有155个,其中表达量上调的97个,表达量下调的58个;在再分化过程差异表达的TF编码基因有68个,其中表达量上调的40个,表达量下调的28个;而在野生型WS从脱分化向再分化转变的过程,总共检测到231个差异表达的TF编码基因,包括160个表达量上调的基因和71个表达量下调的基因.其中,MYB-related (v-myb禽成髓细胞瘤病毒癌基因)家族的不定芽相关转录因子基因ART1在be1-3突变体脱分化阶段的表达量提高了3 217倍,是表达量上调最大的TF编码基因.进一步研究发现,该基因过量表达导致愈伤形成和不定芽再生缺陷,并抑制了幼苗特别是主根的生长发育,表明该基因是愈伤形成和不定芽再生过程的一个负调控因子.本研究不仅加深了人们对不定芽再生转录调控机制的认识,而且为今后不定芽再生相关转录因子的研究提供了大量候选基因信息.
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作者：
作者单位：
山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801;山西农业大学农业生物工程研究所,山西太谷 030801
[1]
山西农业大学文理学院,山西太谷,030801
[2]
山西农业大学生命科学学院,山西太谷,030801
[3]
山西农业大学农业生物工程研究所,山西太谷 030801;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室,山西太原030031
[4]
期刊：
《生物工程学报》2015年31卷4期 552-565页
MEDLINEISTICPKUCSCD
关键词：
不定芽再生愈伤组织形成RNA-Seq转录因子转录调控拟南芥adventious shoot regenerationcallus formationRNA-Seqtranscription factortranscriptional regulationArabidopsis thaliana
栏目名称：
农业生物技术
DOI：
10.13345/j.cjb.140529
发布时间：
2015-05-29
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