Yeast基因下游二级结构与多聚腺苷作用信号
Secondary Structure of Yeast Genomic Downstream Region and Polyadenylation Signals
摘要形成真核生物mRNA 3′末端的多聚腺苷(poly(A))作用涉及前体mRNA下游的三个元件:效率元件(EE)、定位元件(PE)以及实际的剪切和poly(A)作用位点,实验研究提出了一些EE和PE的碱基序列组成.对180个Yeast基因下游(终止密码子后200个碱基)二级结构进行的详细分析显示,约86%的EE、89%的PE与二级结构中碱基非配对的环(发夹环、膨胀环、内环或多分支环)区或连接单链区有关.这个结果提示,反式因子对EE和PE的识别和作用在一定程度上有赖于EE和PE的二级结构特征.借助mRNA二级结构可以提高对EE和PE位点预测的准确性.
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