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基于基因数据库分析CD44在胶质瘤中的表达及意义

Expression of CD44 and Its Prognostic Role in Glioma : Analysis Based on the Data-mining of Gene Database

摘要:

目的 研究CD44在胶质瘤中的表达和临床意义,以及CD44下调对胶质瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的影响.方法 检索Oncomine数据库中关于CD44的信息,对其在各类型肿瘤及胶质瘤中的表达情况进行检索.利用R2基因分析可视化平台及TCGA数据库中下载的胶质瘤基因芯片数据集,分析CD44的表达水平与胶质瘤患者预后的关系.通过siRNA抑制CD44的表达,通过CCK-8试验、Transwell小室、流式细胞术检测CD44下调对胶质瘤U251细胞增殖、侵袭和凋亡的影响.结果 Oncomine数据库中共收集了467项不同肿瘤类型的关于CD44的研究结果,对比正常组织,有统计学差异的结果有68项,其中CD44表达增高的有51项,表达降低的有17项.胶质瘤中高表达的有10项,未搜索到低表达的项目,10项研究共包括955例样本.分析R2基因分析可视化平台(包含504例胶质母细胞瘤)及TCGA数据库(包含529例低级别胶质瘤)的基因芯片数据发现,CD44高表达患者预后更差.在胶质母细胞瘤中CD44高、低表达组患者2年生存率分别为13%和25%(P=0.000 1),在低级别胶质瘤中CD44高、低表达组患者5年生存率分别为47%和61%(P=0.001 0).采用特异性针对CD44基因的siRNA转染U251胶质瘤细胞可显著抑制CD44的表达,与阴性对照组和空白对照组相比,转染组的细胞增殖和侵袭明显受到抑制,且流式细胞学显示转染组对比阴性对照组细胞凋亡率增加,分别为7.10%和4.11% (P<0.05).结论 CD44在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤预后判断指标及潜在的治疗靶点.

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作者: 郭秋云 [1] 胡广原 [1] 韩娜 [1] 石磊 [1] 于洋 [1] 陈承奇 [1] 张孟贤 [1]
分类号: R739.4
栏目名称: 论著
DOI: 10.3870/j.issn.1672-0741.2017.03.001
发布时间: 2017-08-30
基金项目:
国家自然科学基金资助项目
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