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基于TCGA数据库探讨食管癌免疫细胞浸润模式与临床特征和预后的相关性研究

Study on the relationship between immune cell infiltration pattern and clinical characteristics and prognosis of esophagus cancer based on TCGA database

摘要:

目的 探讨食管癌免疫细胞浸润模式与临床特征和预后的相关性.方法 从公共数据库癌症基因组图谱(TCGA)中下载所有食管癌转录本数据以及临床相关数据,通过Cibersort软件计算22种浸润性免疫细胞类型的相对比例.采用Perl评估食管癌免疫细胞浸润模式与临床特征(年龄、性别、临床分期、肿瘤分级)的相关性,通过Kaplan-Meier Log-rank法计算食管癌免疫细胞浸润模式与生存的相关性.结果 采用Cibersort评估了160例食管癌和11例正常组织免疫细胞的分布情况.食管癌组织与正常组织相比,M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的CD4+记忆性T细胞含量较高;浆细胞、M2巨噬细胞、静息状态的肥大细胞的含量较低.M0巨噬细胞与患者临床N分期呈负相关(P<0.05);静息状态树突状细胞与活化的肥大细胞构成比高者总生存期相对较短(P<0.05).结论 与正常组织相比,食管癌组织中免疫细胞的组成具有一定程度的特异性,这也许可以为食管癌的早期筛查与诊断提供思路;与此同时,不同分期的癌症患者可能存在不同的免疫细胞浸润模式,临床可以此为基础,探索发现药物靶标;M0巨噬细胞可能作为食管癌临床免疫治疗的疗效预测指标.

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作者: 米琛 [1] 蒋荣伟 [2] 任莉 [1] 师文 [1] 罗玉梅 [1]
分类号: R735.1R571
栏目名称: 论著
DOI: 10.3969/j.issn.1672-2159.2021.01.005
发布时间: 2021-04-06
基金项目:
陕西省科学技术研究发展计划项目
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