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小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟

Prediction of epitopes and three-dimensional structure modeling from triticum aestivum allergen Tri a Bd 27k

摘要:

目的 通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据.方法 在Uniprot数据库中获得Tri a Bd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估.在Uniport 数据库搜索Tria Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx 1.83及Mega 3.1构建同源进化树.结果 小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定.结论 通过对小麦过敏原Tria Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础.

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作者: 翟锦明 [1] 何颖 [2] 陈惠芳 [2] 刘雪婷 [2] 邹泽红 [2] 夏宏林 [2]
作者单位: 广州医学院第二附属医院,广东广州,510260 [1] 广州医学院第二附属医院,广东广州510260;广州市过敏反应与临床免疫重点实验室/呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室 [2]
期刊: 《现代预防医学》2013年40卷15期 2867-2871页 ISTICPKU
分类号: R392.1
栏目名称: 实验技术及其应用
发布时间: 2013-09-03
基金项目:
广东省医学科研基金课题 国家自然科学基金项目 国家科技重大专项
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