大豆根系应答重金属Cd胁迫的转录组分析-论文-万方医学网

大豆根系应答重金属Cd胁迫的转录组分析

Transcriptome analysis of response to heavy metal Cd stress in soybean root

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摘要：

重金属镉(Cd)作为一种非生命活动所需的常见污染物,在土壤中以低浓度存在时,便可以对生物体产生极强的毒性,影响农作物的生长发育.为了解大豆对重金属Cd胁迫应答的分子机制,把发芽7d的大豆苗在75 μmol·L-1Cd浓度中处理0、4、8、12和48 h,然后取根进行转录组表达分析.共得到2670个表达差异基因,其中4、8、12和48 h处理组中分别有244、1545、442和1401个基因显示了表达差异.这些基因通过GO分类,可分为56类;采用COG数据库进行比对,根据其功能大致可分为25类.KEGG通路富集分析表明,差异表达基因主要富集在苯丙氨酸代谢、泛醌和其他萜类醌生物合成,以及半胱氨酸和甲硫氨酸代谢等通路中.发现3个异黄酮2'-羟化酶基因、2个异黄酮还原酶基因和1个查尔酮合成酶基因在Cd胁迫下均表达上调.RT-PCR检测4个差异表达基因的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性.

作者：张晓娜 ^[1] 朴春兰 ^[2] 董友魁 ^[3] 崔敏龙 ^[2]

作者单位：中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室,沈阳110016;中国科学院大学,北京100049 ^[1] 中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室,沈阳,110016 ^[2] 辽宁省铁岭市农业科学院,辽宁铁岭,112616 ^[3]

期刊：《应用生态学报》2017年28卷5期 1633-1641页 MEDLINEISTICPKUCSCDBP

关键词：大豆重金属镉转录组 soybean heavy material cadmium transcriptome

主题词：黄豆(Soybeans)金属, 重(Metals, Heavy)转录组(Transcriptome)基因(Genes)镉(Cadmium)

DOI： 10.13287/j.1001-9332.201705.004

发布时间： 2017-07-26

基金项目：

国家自然科学基金项目(31370526)资助 This work was supported by the National Natural Science Foundation of China

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