同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响-论文-万方医学网

同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响

Interference of Homologous Sequences on the SNP Study of CYP2A13 Gene

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摘要：

背景与目的已有研究表明:细胞色素P450酶2A13(cytochrome P450 2A13,CYP2A13)在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与疾病关联中起重要作用.细胞色素P450酶是一组同工酶,基因序列间有高度的同源性,可能对SNP分析产生影响.本研究初步探讨同源序列对CYP2A13基因SNP研究的影响.方法应用Taqman探针检测573例人群rs8192789位点的分布,采用BLAST方法分析引物结合序列.对60例样本的CYP2A13序列进行测序,进一步进行了TA克隆测序,应用BLAST方法分析了克隆测序结果.结果 rs8192789位点在573例人群中只有3例为TT纯合型,其余均为CT杂合型,BLAST分析为同源序列导致.60例人群CYP2A13部分序列测序结果完全一致,有大量套峰,101氨基酸位点处没有dbSNP数据库中报道的SNP位点.克隆测序为247 bp、235 bp两个片段.结论 CYP2A13的同源序列对SNP研究造成了干扰,部分SNP位点可能是不存在的.

作者：滑峰 ^[1] 万海粟 ^[1] 梅朝蓉 ^[1] 郑德杰 ^[1] 孙琳琳 ^[1] 陈军 ^[1] 刘红雨 ^[1] 周清华 ^[1]

作者单位：天津医科大学总医院,天津市肺癌研究所,天津市肺癌转移与肿瘤微环境重点实验室,天津,300052 ^[1]

期刊：《中国肺癌杂志》2010年13卷2期 94-97页 MEDLINEISTICPKUCSCD

关键词：细胞色素P450代谢酶2A13 单核苷酸多态性同源序列

主题词：序列同源性(Sequence Homology)研究(Research)基因(Genes)细胞(Cells)多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide)

分类号： R734.2

栏目名称： 基础研究

DOI： 10.3779/j.issn.1009-3419.2010.02.02

发布时间： 2010-04-13

基金项目：

国家科技攻关项目 国家高技术研究发展计划(863计划) 天津市科技支撑计划中瑞合作重大项目

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被引：2
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