• 医学文献
  • 知识库
  • 评价分析
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批
论文 期刊
取消
高级检索

检索历史 清除

医学文献 >>
  • 全部
  • 中外期刊
  • 学位
  • 会议
  • 专利
  • 成果
  • 标准
  • 法规
知识库 >>
  • 临床诊疗知识库
  • 中医药知识库
评价分析 >>
  • 机构
  • 作者
热搜词:
换一批

肠致病性大肠埃希菌EPECDeng致病岛基因进化特点

Genomic evolution characteristics of pathogenicity islands of enteropatho-genic Escherichia coli Deng strain

摘要:

目的:分析肠致病性大肠埃希菌(EPEC)致病岛(PAIs)基因进化特点。方法 EPEC Deng 分离自我国婴幼儿腹泻患者粪便标本,鉴定该菌株血清型并进行药敏试验;采用 Illumina 2000仪器对菌株进行全基因序列测序,PHAST 软件定位菌株原噬菌体(prophages,PPs)在染色体中的位置,MUMmer 软件进行共线性分析,构建系统发育树,了解同源基因进化规律。应用 PAI finder 软件对基因组进行 PAIs 预测,了解 PAIs 核心区域(LEE)和核心基因同源进化规律,并进行遗传多态性分析。结果 EPEC Deng 菌株归属 O119∶H6,药敏结果显示该菌株对环丙沙星、左氧氟沙星及氨苄西林耐药,对其余的抗菌药物均敏感。基因组(染色体)序列大小为5025482 bp (GC 含量为50.52%),质粒序列大小为207564 bp(GC 含量为49.50%)。共找到17个 PPs,系统发育树分析发现,EPEC Deng 株基因组与 O26∶H11、O111∶H 同源性较高;EPEC Deng 株 PAIs 和核心基因均与 RDEC-1和O26∶H413/89-1株具有高同源性;遗传多样性分析结果显示,紧密素(eae )及其受体(tir)多态性丰富,π值均>0.10,Ⅲ型分泌系统(TTSS)分泌蛋白相对稳定。结论此研究明确了 EPEC Deng 株基因组及 PAIs 的进化特点,有助于了解了本土分离的 EPEC 基因特点。

更多
  • 浏览:329
  • 下载:60

加载中!

相似文献

  • 中文期刊
  • 外文期刊
  • 学位论文
  • 会议论文

加载中!

加载中!

加载中!

加载中!

特别提示:本网站仅提供医学学术资源服务,不销售任何药品和器械,有关药品和器械的销售信息,请查阅其他网站。

  • 客服热线:4000-115-888 转3 (周一至周五:8:00至17:00)

  • |
  • 客服邮箱:yiyao@wanfangdata.com.cn

  • 违法和不良信息举报电话:4000-115-888,举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn,举报专区

官方微信
万方医学小程序
new翻译 充值 订阅 收藏 移动端

官方微信

万方医学小程序

使用
帮助
Alternate Text
调查问卷