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基于细菌16S rRNA基因扩增临床不常见病原菌的价值

Value of 16S rRNA gene amplification for identification of clinical rare pathogens

摘要:

目的 探讨16S rRNA基因扩增与测序在临床不常见病原菌鉴定中的价值,指导临床相关感染的诊治.方法 选择临床微生物实验室常规方法难以准确鉴定、无法鉴定或有特殊表型的细菌12株,采用聚合酶链反应(PCR)扩增其16S rRNA基因,测序后进行BLAST比对鉴定菌种,并分析相关感染的临床特点.结果 12株菌经PCR扩增均得到阳性条带(约1500 bp),均鉴定到种(相似度≥99%),分别为产单核细胞李斯特菌、马耳他布鲁杆菌各2株,死亡梭杆菌、空间罗氏菌、鼻疽奴卡菌、解糖葡萄球菌、放射性根瘤菌、二路普雷沃菌、解甘露醇罗尔斯顿菌及阴道阿托波菌各1株.16S rRNA基因扩增灵敏度高,大肠埃希菌ATCC 25922的最低检测限为1.5×101 CFU/mL.12例患者临床资料显示上述菌可引起临床多部位、多类型感染,选用针对性抗菌药物治疗后11例好转,1例死亡.结论 16S rRNA基因测序方法可快速、准确鉴定少见菌、厌氧菌及难培养细菌,为临床不同类型感染的病原学诊断和治疗提供实验室依据.

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作者: 曹敬荣 [1] 高世超 [1] 陈典典 [1] 陈静 [2] 闵嵘 [1] 王培昌 [1]
第一作者: 曹敬荣
作者单位: 首都医科大学宣武医院,北京,100053 [1] 首都医科大学宣武医院,北京 100053;江西卫生职业学院,江西 南昌 330201 [2]
期刊: 《中国感染控制杂志》2016年15卷4期 222-226页 ISTICPKU
分类号: R181.3+2
栏目名称: 论著
DOI: 10.3969/j.issn.1671-9638.2016.04.002
发布时间: 2016-06-03
基金项目:
首都临床特色应用研究重点专项课题
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