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利用生物信息学探索介导鲍曼不动杆菌血流感染的相关蛋白

Exploring on related proteins mediating Acinetobacter baumannii blood-stream infection based on bioinformatics

摘要:

目的 探索介导鲍曼不动杆菌(AB)血流感染的相关蛋白,为AB血流感染提供新的研究方向.方法 在AB基因数据库中检索多位点序列分型(MLST)相同,分离部位不同的AB菌株,采用生物信息学的方法分析仅存在于血流感染AB中的差异蛋白,并进行功能注释分析.结果在设定的检索条件下,共检索10株AB,按MLST分为3组,其中ST92型4株(分离自血、痰各2株)、ST137型4株(分离自血、痰各2株)、ST365型2株(分离自血、痰各1株).基因、蛋白数据库分析结果显示,部分蛋白仅存在于血流感染AB中,不存在于分离自痰的AB中,其中ST92、ST137、ST365型血流感染AB中分别存在20、4、22个特有蛋白.特有蛋白参与的生物学过程主要集中在:细菌毒力与侵袭力、细菌代谢、DNA合成、DNA损伤及修复、转录、翻译、基因转座、以及噬菌体相关蛋白等通路上.结论 由于个体差异性,同一 MLST 的 AB 上述蛋白表达的差异,可能是导致其发生血流感染的原因.

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作者: 冯文艳 [1] 张扣兴 [1]
期刊: 《中国感染控制杂志》2018年17卷12期 1060-1064页 ISTICPKU
分类号: R378.99
栏目名称: 论著
DOI: 10.3969/j.issn.1671-9638.2018.12.006
发布时间: 2018-12-24
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