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HBsAb 滴度高于10000 mU/ml外周血BCR CDR3受体库的组成及特征分析

Analysis of BCR CDR3 repertoire of peripheral blood with HBsAb titer higher than 10 000 mU/ml

摘要:

目的:分析HBsAb滴度>10000 mU/ml外周血 BCR CDR3受体库的组成及特征,寻找可能的HBsAb 序列,为维持后续研究提供数据基础。方法:提取 HBsAb 滴度高于10000 mU/ml 样本的 PBMC 总 DNA,外送美国 Adaptive Biotechnologies ImmunoSEQ平台行Illumina Solexa高通量测序,用IMGT数据库中的High V-QUEST软件初步分析BCR CDR3受体库IGHV、IGHJ和IGHD基因亚群的分布情况、IGHV-J配对取用情况、CDR3区氨基酸长度分布及氨基酸取用情况,并与NCBI数据库中HBsAb序列进行比对。结果:实验样本均高频取用基因亚群IGHV3、IGHV4,IGHJ4、IGHJ6,IGHD3、IGHD6;高频取用配对IGHV3-J4、IGHV3-J6。 CDR3区氨基酸长度均以14及15个氨基酸长度为中线呈正态分布,高频取用的氨基酸依次为Y、G、D、A、R、S,在107、108、109、113、114位点呈现氨基酸多样性取用,在105、106、115、116、117位点上取用氨基酸保守。与NCBI数据库中HBsAb序列比对,得到IGHV、IGHJ、CDR3氨基酸长度完全一致的独特序列共48条。结论:HBsAb 滴度高于10000 mIU/ml样本BCR CDR3受体库的组成具备基本一致的特征,获得的48条独特序列为维持后续研究提供了坚实的数据基础。

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