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ChIP-seq技术在全基因组范围内分析膜性肾病患者组蛋白H3K9三甲基化状态的改变

Genome-wide analysis of histone H3K9 trimethylation by ChIP-seq of membranous nephropathy patients

摘要:

目的 膜性肾病以基底膜(GBM)弥漫性增厚以及上皮下免疫复合物沉积为特征,其发病机制目前仍不明了.H3K9三甲基化在早些年就已经发现了,但其与其他表观遗传修饰间的微妙关系以及在人类疾病中潜在的意义仍不清楚.该实验选择组蛋白H3K9三甲基化作为靶标,探讨H3K9三甲基化与膜性肾病发病机制的关系.方法 实验采用染色质免疫沉淀-高通量测序(ChIP-seq)分析膜性肾病患者外周血单个核细胞(PBMCs)的组蛋白H3K9三甲基化状态的改变.结果 与健康对照组相比,膜性肾病H3K9me3有108个差异表达基因,其中75个上调,33个表达下调.挑选5个差异最大的基因,DGCR6、SNX16、CNTN4、BIRC3和BIRC2进行讨论.结论 研究结果表明膜性肾病患者的H3K9三甲基化状态有很大的变化,这些变化或许可以进一步揭示膜性肾病的发病机制,并提供潜在的治疗靶点.

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作者: 眭维国 [1] 何慧燕 [2] 晏强 [1] 崔甄甄 [2] 张若菡 [2] 戴勇 [1]
分类号: R692
栏目名称: 临床论著
DOI: 10.3969/j.issn.1005-8982.2013.32.011
发布时间: 2016-01-23
基金项目:
广西自然科学基金重点项目 桂林市科技创新平台与企业创新能力建设项目
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