基因芯片数据库GEO与ArrayExpress的使用及比较分析
Usage and comparative analysis of GEO and Arrayexpress Microarray Database
摘要:
本文比较了两种常用综合基因芯片数据库GEO与ArrayExpress的使用.从数据库概念与结构、检索、上传与下载方法及数据分析方式等几个方面进行比较分析.两个数据库均分为原始数据库与集成数据库两部分,GEO的原始数据又分别放置于平台、样本和系列中;检索结果内容有很大的相似性;但ArrayExpress同时引用了GEO中的数据;数据上传需要运用数据库自带的上传工具;数据下载可直接在线进行;两个数据库均带有分析工具.两个数据库各有特点,使用者可根据研究需要和自身喜好进行选择或综合利用.
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作者:
作者单位:
中南大学湘雅医院肝胆肠外科研究中心,湖南长沙,410008
[1]
中南大学生物医学工程研究院,湖南长沙,410008
[2]
期刊:
《中国现代医学杂志》2014年24卷12期 38-42页
ISTICPKU
分类号:
R-1
栏目名称:
综述
DOI:
10.3969/j.issn.1005-8982.2014.12.009
发布时间:
2016-01-23
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