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串联质谱检测和高通量测序对青海地区新生儿出生缺陷筛查和诊断的横断面调查

Cross-sectional study on screening and diagnosis of neonatal birth defects in the Qinghai area by tandem mass spectrometry and high throughput sequencing

摘要:

目的 运用串联质谱检测和高通量测序(NGS)技术,初步分析青海高海拔地区新生儿出生缺陷的发病率及病种情况,探讨青海地区行串联质谱检测+NGS对新生儿出生缺陷防治的价值.方法 对2018年1月8日至10月18日青海部分地区活产新生儿足跟血行串联质谱遗传代谢病筛查(包含20种氨基酸代谢病、12种脂肪酸代谢病和17种有机酸代谢病),对串联质谱筛查结果异常的新生儿人群及串联质谱筛查人群中具有特殊面容、结构畸形新生儿,母亲有不良孕产史的新生儿行NGS检测,考察串联质谱+NGS筛查(包含2742个已知致病基因)新生儿出生缺陷的作用和价值.结果 研究期问共收集新生儿干血滴滤纸片4016份(例),男性2125例(51.6%),汉族2332例(58.1%),藏族755例(18.8%),回族659例(16.4%),串联质谱筛查提示代谢异常59例(1.47%),提示遗传代谢病(IMD)可能5例,继发改变可能54例.经NGS基因分析确诊3例IMD,包括氨基酸代谢病2例(高苯丙氨酸血症2例)以及脂肪酸代谢病1例(原发性肉碱缺乏症),遗传代谢病总发病率为1/1339.NGS检测基因变异8例(含3例IMD),拷贝数变异6例.青海地区汉、藏、回民族新生儿血氨基酸及肉碱水平差异有统计学意义(P<0.05).结论 青海高原地区新生儿串联质谱IMD筛查阳性率较国内平原地区高;NGS不仅可以从基因水平确诊质谱筛查提示的阳性病例,还可以诊断高危新生儿串联质谱筛查无法检出的其他新生儿出生缺陷.

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