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丹参酮生物合成途径CYP450基因相关长链非编码RNA的筛选

Screening of long non-coding RNA related to CYP450s involved in biosynthesis of tanshinones

摘要:

丹参酮是中药丹参的主要有效成分,其生物合成途径表明细胞色素CYP450酶在丹参酮生物合成途径结构后修饰过程中发挥着重要作用.长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的核苷酸,对药用植物的生长发育、次生代谢等具有重要调控作用.该研究通过对丹参毛状根进行诱导,利用高通量测序构建其长链非编码RNA文库,共获得8 942个差异lncRNA,其中6 755个基因间lncRNA,并鉴定出1 115 814个lncRNA-靶基因对,包括122个lncRNA-靶基因顺式对.对差异lncRNA与CYP450进行相关性分析,共鉴定出16 249个lncRNA-CYP450靶基因对.将其与丹参酮生物合成途径CYP76AH1,CYP76AH3,CYP76AK1基因进行靶向相关性分析,得到216个靶基因,这些候选基因为丹参酮生物合成途径下游调控机制研究奠定基础.

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作者: 蔡媛 [1] 马莹 [2] 郭娟 [2] 王勇庆 [1] 杜青 [1] 陈同 [2] 张水寒 [1] 黄璐琦 [2]
作者单位: 湖南省中医药研究院中药研究所,湖南长沙,410006 [1] 中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地,北京,100700 [2]
期刊: 《中国中药杂志》2019年44卷12期 2480-2485页 MEDLINEISTICPKUCSCD
栏目名称: 分子生药学
DOI: 10.19540/j.cnki.cjcmm.20190324.101
发布时间: 2019-07-30
基金项目:
国家自然科学基金青年基金项目 中央本级重大增减支项目 湖南省自然科学基金青年基金项目 湖南省中医药管理局项目 湖湘中药资源保护与利用2011协同创新中心项目
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