胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究-论文-万方医学网

胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究

Cluster analysis of gene expression and glioblastoma-associated gene by using cDNA microarray

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摘要：

目的探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能.方法用含13 939种人类基因的BioStarH140S型表达谱芯片,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片;ScanArray 4000扫描芯片荧光信号,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取;用Northern杂交验证及进行初步功能研究.结果正常脑与18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因,通过生物信息学和Hierarchical聚类,发现α-连环素、微型染色体维护蛋白7、细胞周期素B2、FBX05、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显,但胶质母细胞瘤中表达明显上调.Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关,与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因,发现的5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关,可成为判断胶质瘤预后的分子生物学指标.

作者：陈菊祥 ^[1] 卢亦成 ^[1] 胡国汉 ^[1] 骆纯 ^[1] 楼美清 ^[1] 应康 ^[2] 李瑶 ^[2] 谢毅 ^[2]

作者单位：第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,200003 ^[1] 复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海,200433 ^[2]

期刊：《中华神经外科疾病研究杂志》2004年3卷3期 222-225页 ISTIC

关键词：脑胶质母细胞瘤基因芯片表达谱 Hierarchical聚类

主题词：基因(Genes)胶质母细胞瘤(Glioblastoma)脑(Brain)肿瘤(Neoplasms)基因表达谱(Gene Expression Profiling)

分类号： R739.4

栏目名称：论著

DOI： 10.3969/j.issn.1671-2897.2004.03.009

发布时间： 2004-07-09

基金项目：

上海市科委资助项目 国家自然科学基金

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被引：8
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