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基于支持向量机对肾母细胞瘤患者血清蛋白质标记物的检测分析

Detecting biomarkers from serum in nephroblastoma patients with support vector machine

摘要:

目的 检测肾母细胞瘤患儿血清蛋白质,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于肾母细胞瘤早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测75例血清标本(肾母细胞瘤30例,其他小儿腹腔实体肿瘤25例,正常小儿20例)的蛋白质质谱,并结合生物信息学方法(支持向量机)分析数据.结果 筛选出4个质荷比(m/z)位于6984.5、6455.5、6914.0、3256.7的蛋白质标记物,构建肾母细胞瘤早期诊断模型.经留一法交叉验证,区分肾母细胞瘤和正常小儿的血清蛋白质指纹图谱模型特异性为100%,敏感性为100%;区分肾母细胞瘤与其他腹腔实体肿瘤的血清蛋白质指纹图谱模型特异性为100%,敏感性为93.3%.结论 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术结合支持向量机建立肾母细胞瘤血清蛋白质指纹图谱模型是早期诊断肾母细胞瘤的一种特异性强、敏感性高的新方法,可用于肾母细胞瘤早期诊断与肿瘤标志物筛选研究.

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