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抗菌肽LL-37序列分析与结构研究

Sequence and structure of antimicrobial peptide LL-37

摘要目的:分析抗菌肽L L‐37的序列和结构特征,模拟其与棕榈酰转移酶Pag P三维结构的结合,为后续研究抗菌机制提供理论和实验基础。方法从PDB数据库获得抗菌肽L L‐37、棕榈酰转移酶 Pag P的序列和结构信息,使用SWISS‐MODEL、NCBI在线工具和ANT HEPROT6.6.6、AutoDock4.2等软件对抗菌肽LL‐37进行序列和结构分析。结果抗菌肽L L‐37序列全长为37个氨基酸,含有75.7%α螺旋和24.3%无规则卷曲,抗菌肽LL‐37片段与棕榈酰转移酶PagP形成8种对接模式,其配体效率在-2.2389~-1.6100 Kcal/mol之间。结论对抗菌肽L L‐37的序列和结构研究,为后续针对特异靶点设计多肽药物,开展结构与活性的研究提供了新的方向。

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中华医院感染学杂志

中华医院感染学杂志

2016年26卷22期

5076-5079页

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