非肌层浸滑性膀胱癌环状RNA表达谱及生物信息学分析-论文-万方医学网

非肌层浸滑性膀胱癌环状RNA表达谱及生物信息学分析

Circular RNA expression profile and bioinformatics analysis of non-muscle-invasive bladder cancer

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摘要：

目的:筛选非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者癌组织及癌旁组织中差异性表达的环状RNA (circRNA),探讨circRNA在NMIBC发病中的作用.方法:利用高通量芯片测序技术检测5例NMIBC患者癌组织及癌旁组织circRNA表达谱,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行生物信息学分析.结果:与癌旁组织相比,癌组织标本内共有315条circRNA异常表达(上调158条,下调157条).通过miRanda(3.3a)软件对差异表达量上调和下调的前10位circRNA的miRNA结合位点进行逐条预测,提示上述差异表达circRNA可能通过分子海绵吸附作用影响NMIBC的发生与发展,其分别参与ATP的合成、钙离子调控或细胞膜功能的调控、BCRA1基因的转录调控和脂质代谢等生物过程.结论:NMIBC患者中circRNA表达谱发生了显著变化,hsa_circ_0004045、hsa_circ_0006328、hsa_circ_0000837、hsa_circ_0002229可能通过海绵吸附作用调控相应的miRNA表达,在NMIBC的发生和发展中发挥重要作用.

作者：何宇辉 ^[1] 邓益森 ^[1] 彭畔新 ^[1] 王爱军 ^[2] 张晓云 ^[2] 李俊杰 ^[2] 周晓峰 ^[1]

作者单位：中日友好医院泌尿外科,北京100029;北京大学中日友好临床医学院,北京100029 ^[1] 中日友好医院泌尿外科,北京,100029 ^[2]

期刊：《中日友好医院学报》2018年32卷3期 143-147页 ISTIC

关键词：非肌层浸润性膀胱癌环状RNA 生物信息学 non-muscle-invasive bladder cancer circular RNA bioinformatics

主题词：性(Sex)肌(Muscles)计算生物学(Computational Biology)癌(Carcinoma)组织(Tissues)

分类号： R737.14

栏目名称： 临床论著

DOI： 10.3969/j.issn.1001-0025.2018.03.004

发布时间： 2018-07-23

基金项目：

国家国际科技合作专项 国家自然科学基金

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被引：1
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