换一批纳米孔测序技术在1例呼吸道感染患者病原检测中的应用
Application of nanopore sequencing technology in pathogen detection in a patient with respiratory infection
摘要目的 探索快速识别呼吸道感染患者致病病原的方法,为临床早期诊断与治疗提供支持.方法 基于纳米孔掌上测序仪MinION对1例患者肺泡灌洗液进行实时测序,用BGI测序平台对样本开展宏基因组测序,并对样本进行痛原菌分离培养实验.结果 基于纳米孔测序技术的宏基因组测序在55 min内即检测到铜绿假单胞菌特异序列,后续的二代测序及分离培养实验进一步证实了致病痛原为铜绿假单胞菌.结论 在该例病原检测中,纳米孔测序技术将检测周期缩短至12h左右,与其他方法相比具有更短的检测周期,有望成为临床感染病原实时检测的重要辅助手段.
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