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颖蜡蝉科昆虫DNA条形码的研究

摘要颖蜡蝉科Achillidae隶属于半翅目Hemiptera头喙亚目Auchenorrhyncha蜡蝉总科Fulgoroidea,部分种类为农林害虫,具有十分重要的经济意义。基于形态特征的传统鉴定方法在实际工作中面临许多困难。本研究将DNA条形码技术首次应用于颖蜡蝉科昆虫,采用PCR产物直接测序法测定了昆虫的线粒体基因COI、16SrDNA、Cytb基因及核基因28SrDNA、核糖体ITS1基因的部分片段序列,采用CLUSTALXI.1.83、DNAman、MEGA5.05、等系统发育分析相关软件对序列进行了比对、碱基组成、碱基替换、遗传距离等分析,在系统发育分析前对序列进行了替换饱和性分析,结果显示碱基替换没有明显的饱和趋势。采用最大简约法(MP)、邻接法(NJ)构建颖蜡蝉科部分种类的系统发育关系,得出以下结论:<br>  1.序列组成分析<br>  获得颖蜡蝉科昆虫中线粒体基因COI、16S rDNA、Cytb及核基因28SrDNA、ITS变异位点百分比分别为81.2%、86.1%、83.1%、94%和83.6%;碱基A+T含量百分比分别为64.3%、73.5%、70.5%、40.3%和40.8%,和其他昆虫一样线粒体基因存在着明显的AT偏好性。<br>  2.碱基替换饱和性分析<br>  在系统发育分析前对序列进行了替换饱和性分析,结果显示碱基替换均没有出现明显的饱和趋势。转换数均小于颠换数,从各个数据组来看,转换以TT和AA之间的转换居多,颠换中以CC和GG颠换为主,CG之间的颠换最少。<br>  3.遗传距离分析<br>  COI基因12属19种颖蜡蝉的地理种群遗传距离介于0.000-0.068,种间的遗传距离介于0.124-0.180,属间遗传距离介于0.140-0.229;16S rDNA基因13属24种颖蜡蝉的地理种群遗传距离在介于0.000-0.020之间,种间的遗传距离为多数在介于0.042-0.211之间,属间遗传距离多数介于0.101-0.220之间;Cytb基因12属15种颖蜡蝉地理种群之间遗传距离在介于0.000-0.082之间,属内种间遗传距离介于0.068-0.095之间,属间遗传距离介于0.087-0.258之间;28S rDNA15属21种颖蜡蝉地理种群之间遗传距离在介于0-0.003,属内种间遗介于0.003-0.010,属间遗传距离最大值介于0.011-0.276;ITS1基因13属19种颖蜡蝉地理种群遗传距离介于0-0.009之间,属内种间的遗传距离介于0.082-0.178,属间遗传距离介于0.121-0.520之间;16S rDNA&28SrDNA基因9属10种颖蜡蝉地理种群遗传距离介于0.000-0.001,属内种间的遗传距离介于0.027-0.028,属间遗传距离介于0.030-0.194之间。<br>  4.系统发育分析<br>  根据各种系统发育树综合得出如下结果:(1)菲颖蜡蝉族Plectoderini为比较进化的类群,处于树的端部(除Cytb);罗颖蜡蝉族Rhotalini、颖蜡蝉族Achilidae为比较原始的类群,处于树的根部菲颖蜡蝉族为比较进化而罗颖蜡蝉为比较原始的结果与Szwedo(2008)的研究结果一致,而与Fennah(1950)的“菲颖蜡蝉族为最原始类群”相悖。<br>  (2)多基因基因显示丝颖蜡蝉属、乌颖蜡蝉属互为姐妹群;广颖蜡蝉属、罗颖蜡蝉属互为姐妹群;安可颖蜡蝉属和德颖蜡蝉属互为姐妹群;马颖蜡蝉属、贝颖蜡蝉属互为姐妹群。

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导师 陈祥盛
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发布时间 2016-06-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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