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应用SRAP和ISSR分子标记构建红麻的遗传连锁图谱

摘要:

红麻(Hibiscus cannabinus)是麻纺和造纸的重要纤维植物,分子标记辅助育种及遗传连锁图谱构建研究滞后与其他主要作物。目前,红麻的遗传连锁图谱构建尚未见报道,分子标记遗传图谱的构建可以为红麻基因结构提供详细的描述,既是红麻遗传学研究的重要领域,又是红麻基因定位和克隆等应用研究的理论基础。为促进红麻基础科学研究的发展,本研究利用SRAP和IssR分子标记技术构建红麻的遗传连锁图谱,取得以下的研究成果。 (1) 以半野生种Ga42(源自加纳)和栽培种阿联红麻(源自埃及)杂交,F<,1>自交产生的203株F<,2>代分离群体作为作图群体。 (2) 从19X19对SRAP_h游与下游引物组合和30个ISSR引物中,以Ga42和阿联红麻为模板筛选出多态性较好的27对sRAP引物组合和5个ISSR引物。 (3) 利用sRAP和IssR两个分子标记筛选出了32个引物组合及引物,对F<,2>作图群体进行PCR扩增,共产生108个多态条带,平均每个引物组合产生3.4个多态条带,最多的可以产生8条。 (4) 使用Mapmaker/3.0,我们构建了包括68个sRAP标记位点和10个ISSR标记位点的红麻的连锁图谱,这些标记被分为16个连锁群(LOD≥30),总长1423.9 cM,平均两个标记位点间距为18.25cM。每对标记组合可以产生10-50个大小在100-2000bp的清晰可辨的条带,其中70%的条带较亮。 (5) 这108个标记位点当中,有58个(54%)偏离3:1的分离比,偏分离十分严重。在我们的实验中,仅检测到2个共显性位点,和Li等报道的高共显性不太一致。红麻有18对染色体,而我们仅构建出16个连锁群,可能与我们目前所用的多态性引物还不够多有关,因此得到的多态性标记位点密度还不够高,导致有些连锁群位点不够均匀。

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