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捕食线虫真菌节丛孢属、隔指孢属和单顶孢属的分子分类研究

摘要节丛孢属(Arthrobotrys),隔指孢属(Dactylella),和单顶孢属(Monacrosporium)是捕食线虫真菌的主要分类类群.该文选用这三个属18种的34个菌株,通过对进化保守的ITS1,5.8S rDNA和ITS2区进行PCR扩增序列测定,同时结合目前的NCBI基因库中报道的这三个属14个种的ITS区间序列,进行综合序列排列和聚类分析后,得出如下主要结果:1.从PCR扩增结果来看,节丛孢属及相关属基因组中ITS1、5.8S rDNA、ITS2区PCR扩增后长度在500bp-600bp之间,同时摸索并确定了测序扩增体系中的最佳模板浓度,在20μ1的直接测序扩增反应体系中当模板量达240-270ng时,扩增和测序的效果最佳;2.利用Phylip3.5和ClustalX软件包,采用最大简约法(Maximum Pasimony,MP)和临接法(Neighbor joining,NJ),对节丛孢属及其相关属48株菌的序列进行系统进化分析后,发现在系统进化图上,具有相同类型捕食器官的种大致聚集在一起,即可将48株菌按收缩环、非收缩环和粘性球,粘性分支及粘性网等捕食器官特征分成五大类群;3.采用最大简约法(MP法)和临接法(NJ法),分别对单顶孢属属下不同种的菌株进行聚类研究,结果表明属下菌株按分生孢子的形态、分隔以及分生孢子属属下不同种的菌株进行聚类研究,结果支持了以分生孢子的形态、分隔和分生孢子梗的分支等主要形态学特征做为种间分类的标准.

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学位信息:
中国农业科学研究院中国农业科学院 生物学 微生物学(硕士) 1999年
发布时间 2005-07-27(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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