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基于COI序列的DNA条形码在中国沿海缀锦蛤亚科贝类中的应用分析

COI-based DNA Barcoding in Tapetinae Species (Mollusca, Bivalvia, Veneridae) Along the Coast of CHINA

摘要:

该研究探讨了将COI序列应用于中国沿海缀锦蛤亚科贝类物种鉴定的可行性,获得了该亚科5属11种贝类51个个体的43个单倍型序列.碱幕替换饱和性分析表明,颠换未出现饱和现象,而转换在序列分化达到10%至15%时即到达饱和.单倍犁Hap33可能是由杂交引起的,排除此瞥倍型,种内个体间遗传距离在0%到2.02%之间,平均为0.46%,属内不同种个体间遗传距离在17.21%~32.24%之间,平均为24.96%,存在条形码问隙:11种缀锦蛤哑科贝类在邻接树和贝叶斯树上都独立的单系群.该研究表明,基于COI的DNA条形码技术能够将研究所涉及的约98%的缀锦蛤亚科贝类鉴定剑种的水平,因此,利用DNA条形码技术可以对缀锦蛤亚科贝类进行有效地分类鉴定.

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作者: 陈军 [1] 李琪 [1] 孔令锋 [1] 郑小东 [1] 于瑞海 [1]
期刊: 《动物学研究》2010年31卷4期 345-352页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP
分类号: Q959.215Q3491Q951.3
DOI: 10.3724/SP.J.1141.2010.04345
发布时间: 2010-11-02
基金项目:
国家高技术研究发展计划项目 教育部培育资金项目
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