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幽门螺杆菌 hp0521基因编码蛋白的生物信息学分析

Bioinformatical analysis of hp0521 gene encoding protein of Helicobacter pylori

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摘要目的：对4株幽门螺杆菌（Helicobacter pylori， Hp）中 hp0521基因编码的细胞毒素相关基因2（cytotoxin－asso－ciated gene 2，Cag2）蛋白从生物信息学角度进行基本理化性质、信号肽及功能的预测分析。方法：用 PCR 技术克隆测序获得4株 Hp 菌株的 hp0521基因序列，生物信息学工具分析其编码 Cag2蛋白的基本理化性质、有无信号肽及蛋白指纹图谱。结果：成功克隆测序4株 Hp 菌株的 hp0521基因序列，提交基因库后获得相应登录号；hp0521基因编码的Cag2蛋白氨基酸数目和相对分子质量大小不同，理论等电点偏碱性，为稳定亲水性蛋白，不存在信号肽；Cag2蛋白指纹图谱分析存在 DNA 拓扑异构酶Ⅰ、IL－3细胞因子、抗增殖蛋白 BTG1家族、介导细胞壁延伸的蛋白、卤酸脱卤酶／环氧水解酶、调节染色体凝集功能 RCC1家族等蛋白标签。结论： Hp 中 hp0521基因编码的 Cag2蛋白可能介导细胞壁延伸和调节染色体凝集，参与致病信号通路的传导，可能具有 DNA 拓扑异构酶Ⅰ、卤酸脱卤酶／环氧水解酶等相应酶活性。