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多房棘球蚴抗原蛋白 TSP3抗原表位的生物信息学预测#

Bioinformatic prediction of epitopes in the TSP3 antigen of Echinococcus multiloculqris

摘要:

目的:预测多房棘球绦虫抗原蛋白 TSP3的二级结构和优势抗原表位(T 细胞和 B细胞表位)。方法 Genbank 获取 TSP3的氨基酸序列后通过生物信息学软件 SOPMA 预测二级结构特征,进一步通过在线软件 IEDB、SYFPEITHI、Bcepred 和 ABCpred 预测 TSP3的 T 细胞和 B 细胞表位。同时对 TSP3的亲水性、柔韧性、抗原性及蛋白表面暴露区域的特征进行预测。结果无规则卷曲和β转角分别占 TSP3蛋白质的二级结构的25.68%和4.05%,说明潜在优势抗原性表位存在。通过多种生物信息学方法分析出 TSP3潜在的 T 细胞表位为 T33_42、T45_55、T53_63、T68_77、T80_90、T92_104、T110_122、T134_144;TSP3潜在的 B 细胞表位为 T18_33、T45_55、T53_63、T64_75、T80_90、T92_104、T110_122。结论 TSP3的二级结构特征显示潜在优势抗原性表位存在,预测出8种 T 细胞抗原表位和7种 B 细胞抗原表位,为后续表位疫苗的设计奠定了理论基础。

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