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小鼠死后环状RNA的降解规律及其用于死亡时间推断的适用性

Correlation between the degradation of mouse circular RNAs and postmortem interval

摘要:

目的 探讨小鼠小脑组织3种circRNA的降解规律,及其用于死亡时间推断的适用性.方法 应用转录组学方法设计课题.将50只小鼠随机分为两个大组(4℃恒温箱组和20℃恒温箱组),用断颈法处死,每个大组小鼠按照死亡时间分为5个小组(死后0、24、48、96、168h组,每小组5只),其中0h组为对照组.取小鼠小脑组织,利用实时荧光定量PCR技术对β-actin,CDR1as circRNA,Rims2 circRNA及Dym circRNA的表达水平进行检测,使用SPSS19.0软件进行数据分析.结果 CDR1as circRNA的M值在四组候选内参基因中最小,等于0.417;Rims2 circRNA与Dym circRNA的表达量随着死亡时间增加而呈现递减趋势(P<0.05);4℃组Rims2 circRNA与Dym circRNA的三次回归模型的回归系数r2最大(回归方程分别为(y)=1.392+ 2.691x-0.678x2+0.059x3,r2=0.752,P<0.05;(y)=3.767 +4.034x-1.385x2 +0.151x3,r2=0.834,P< 0.05);20℃组Rims2circRNA与Dym circRNA的三次回归模型的回归系数较大(回归方程分别为;=3.532+0.170x+0.060x2-0.008x3,r2=0.544,P<0.05;(y)=5.814-2.172x+0.970x2-0.106x3,r2=0.512,P<0.05).结论 小鼠小脑组织3种circRNA的降解规律:CDR1as circRNA适合作为本实验中的内参基因;Rims2circRNA与Dym circRNA的表达量随着死亡时间增加而呈递减趋势(P<0.05);Rims2 circRNA及Dym circRNA的相对表达量受PMI影响较大(P<0.05);4℃条件下相对于20℃条件下的PMI对circRNA相对表达量的影响更大.

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作者: 郝尔娃 [1] 吴岳 [1] 杨应忠 [1] 马启宁 [2] 赵洪乾 [1] 于聪 [1]
作者单位: 青海大学医学院,青海西宁,816000 [1] 青海省海西州公安局油沙山分局,青海茫崖,816400 [2]
分类号: D919
栏目名称: 基础医学
DOI: 10.13452/j.cnki.jqmc.2019.02.005
发布时间: 2019-07-02
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