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应用cDNA微阵列技术筛选大鼠脊髓损伤修复相关基因

cDNA microarray analysis of spinal cord injury and regeneration related genes in rat

摘要:

脊髓损伤是一类常见的、高致残率的中枢神经系统疾病,由于多种复杂因素影响其损伤后的修复过程,损伤脊髓的再生能力非常有限.本研究采用cDNA微阵列技术筛选大鼠脊髓损伤后出现的差异表达基因.实验组动物在T8-T9进行脊髓全横断手术,对照组动物只打开椎板;4.5 d后取脊髓进行RNA提取并在反转录过程中进行Cy3/Cy5标记,然后与预制的、带有4 041条特异性探针的芯片进行杂交.Cy5/Cy3信号比值≥2.0视为脊髓损伤后出现差异表达的基因.通过筛选,我们得到了65个上调表达基因(21个已知基因,30个已知EST和14个未知基因)和79个下调基因(20个已知基因,42个已知EST和17个未知基因).进一步通过半定量RT-PCR对其中的5个上调已知基因(Timp1,Tagln,Vim,Fc gamma receptor.Ctss)和三个下调已知基因(stearyl-CoA desaturase,F2,Ensa)的表达情况进行了验证,结果显示与芯片结果一致.这些基因可能在脊髓损伤后的修复过程中起一定的作用,对其深入研究将有助于揭示脊髓损伤修复的分子机制.

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作者: 肖林 [1] 马振莲 [1] 李欣 [1] 林秋霞 [1] 阙海萍 [1] 刘少君 [1]
期刊: 《生理学报》2005年57卷6期 705-713页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
分类号: Q42
栏目名称: 研究论文
DOI: 10.3321/j.issn:0371-0874.2005.06.006
发布时间: 2006-02-23
基金项目:
中国科学院资助项目 国家重点基础研究发展计划(973计划) National Key Project of Chinese Sanitation Miministries
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