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初步研究我国土拉菌的亚种及遗传进化关系

Preliminary study and phylogenetic analysis of the subspecies of Francisella tularensis in China

摘要:

目的 研究我国土拉弗朗西斯菌(土拉菌)亚种类型及各菌株之间的遗传进化关系.方法 对于来源于我国北方地区的10株土拉菌,采用2种型特异引物C1C4和RD1进行PCR,根据扩增产物片段长度来判断所属亚种;同时,使用fopA、tul4和16S rRNA引物,进行3种特异基因的PCR,然后测序;这10株土拉菌及网上已公布基因组序列的3株B型土拉菌、l株subsp.novicida,应用MEGA 4软件,进行3种特异基因为基础的系统进化分析.结果 采用2种型特异引物C1C4和RD1,鉴定10株土拉菌均为B型亚种;根据MEGA 4构建的进化树,我国10株土拉菌可以分为2种基因型,410108、410109和410111为B1型,另外7株土拉菌为B2型;而国外的3株B型土拉菌归为B3型.结论 我国北方地区分离的土拉菌可能以B型为主,对于土拉菌B型亚种的起源,我国土拉菌可能早于欧美国家.3种基因为基础的系统进化分析可作为土拉菌基因分型的一种可靠方法.

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