换一批基于生物信息学的溃疡性结肠炎免疫细胞的浸润模式分析
Immune cells infiltrating pattern analysis of ulcerative colitis based on bioinfor-matics
摘要目的:分析溃疡性结肠炎(UC)的免疫细胞浸润情况.方法:从GEO数据库下载GSE11223微阵列测序数据集,样本通过Agilent-012391全人类基因组Oligo微阵列测序,利用R软件和免疫细胞浸润估计分析工具——反卷积算法(CIBERSORT),全面分析UC免疫浸润细胞.22个免疫细胞亚群的比例被评估,免疫浸润在配对正常组织和UC组织之间存在显著差异,这种差异可以表现为特征个体差异.在研究的细胞亚群中,使用免疫细胞比例进行的无监督聚类分析显示了5个亚群.结果:与正常组织巨噬细胞M2(P=0.014)、静息树突状细胞(P=0.012)高表达相比,UC参与固有免疫的特征性细胞有单核细胞(P=0.037)、巨噬细胞M0(P=0.001)、中性粒细胞(P=0.011),UC参与特异性免疫特征性细胞有CD4+记忆性T细胞(P=0.003)、调节性T细胞(P=0.034).细胞亚群1、细胞亚群2的活跃,细胞亚群3和细胞亚群4功能的失调,导致了UC的发生发展.结论:CD4+记忆性T细胞、巨噬细胞M2型、调节性T细胞和UC的发生发展密切相关,而这些差异可能是药物治疗作用效应的重要决定因素.
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