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4-氨基-2-三氟甲基苯基维甲酸酯对人白血病 K562细胞的蛋白质组学研究

The proteomics research of 4-amino-2-trifluoromethyl-phenyl retinate on human leukemia K562 cells

摘要:

目的:研究新型维甲酸衍生物4-氨基-2-三氟甲基苯基维甲酸酯(4-amino-2-trifluoromethyl-phenyl retinate,ATPR)诱导人白血病 K562细胞分化作用的蛋白质组学机制。方法1×10-6 mol·L -1的 ATPR 及 ATRA 分别作用于人白血病K562细胞48 h 后,收集细胞并提取总蛋白,纯化之后使用胰蛋白酶酶解,固相萃取法脱盐,高分辨率液相色谱质谱联用仪检测肽段,使用 Proteome Discoverer 1.2软件寻找出差异表达的蛋白质,利用生物信息学 DAVID 数据库、KEGG 数据库、STRING 数据库,分析鉴定出的差异蛋白质所具有的分子功能、所参与的生物学过程等信息。结果 ATPR 组特异性的蛋白质鉴定出120个,ATRA 组特异性蛋白质有143个,两者共有蛋白422个。 DAVID 分析显示 ATPR 特异性蛋白质主要参与39个生物学过程,包括蛋白质和大分子的代谢、蛋白质转运和定位等。 KEGG 分析发现,ATPR 组特异性蛋白质主要参与新陈代谢过程、PI3K-Akt 信号通路、TGF-β信号通路等其他癌症相关信号通路。 STRING 蛋白相互作用网络分析显示 ATPR 特异性蛋白质,如 EIF3A、EIF6、RPL3、RPL8、RPL13、RPL7A、RPL21、RPS3、RPS14、NACA、BTF3、NHP2L1、PPP2CA 蛋白与其他≥10个相关蛋白存在直接相互作用关系。结论 ATPR 组特异性中心蛋白质均参与对细胞生长增殖、诱导细胞分化和凋亡等过程的调控,这些蛋白质间的相互作用网络及特异性中心蛋白质是 ATPR 诱导 K562细胞分化作用的可能机制。

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