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树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶cDNA和蛋白质序列结构分析

Analysis of Lecithin-cholesterol Acyltransferase cDNA and Protein Sequence from Tree Shrew

摘要:

目的克隆获得树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶cDNA序列并进行结构分析.方法以树鼩肝脏mRNA逆转录出的Ⅰ链cDNA为模板,运用SMART RACE PCR扩增技术,扩增得到树鼩卵磷脂胆固醇酰基转移酶(LCAT)cDNA序列,并推导出LCAT氨基酸序列.利用分子生物学软件DNAMAN对氨基酸序列的一、二级结构及主要结构域进行分析和比较.结果树鼩LCAT cDNA序列由1 340个核苷酸构成,开放阅读框架1 320bp,编码440个氨基酸的LCAT前体(含24个氨基酸构成的信号肽和416个氨基酸组成的成熟蛋白),3'非翻译区18bp,终止密码TAA,加尾信号AATAAA和一个25bp的poly(A)尾.树鼩LCAT cDNA序列已作为新基因被GenBank接受,登记号AE272861.树鼩与人和狒狒LCAT cDNA的同源性分别为90%和89%.结论树鼩LCAT cDNA序列与人及其他实验动物高度同源.

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