换一批
换一批TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌gyrA基因第87位密码子和第91位密码子耐药突变
Employment of TaqMan-MGB fluorescent probe real-time PCR for detection of the quinolones resistant mutations of Helicobacter pylori in Beijing area
摘要：
目的 采用TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子突变情况,比较与药敏试验和一代测序法的一致性.方法 收集北京大学第一医院消化内科门诊尿素酶试验阳性的患者252例,所有患者均使用MGB荧光探针法和一代测序法对喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子进行检测.其中158例患者同时进行药敏试验检测,同时分析耐药位点突变发生率与耐药表型的关系.结果 158例传统培养联合药敏法检测的标本中成功培养出85例,占53.8%,其中耐药型菌株40例,敏感型菌株42例.而MGB荧光探针法成功检出155例,占98.1%,其中野生型93例,突变型62例.在药敏试验检测出的85例阳性标本中,两种方法检出的符合率为94.1%.252例标本中,一代测序法成功检测出234例,占92.9%,其中野生型160例,突变型74例.在74例突变型标本中,含gyrA基因第87位密码子突变的标本占60.8%,含gyrA基因第91位密码子突变的标本占39.2%.MGB荧光探针法成功检测出250例,占99.2%,其中野生型161例,突变型89例.在89例突变组标本中,含gyrA基因第87位密码子突变的标本占64.0%,含gyrA基因第91位密码子突变的标本占36.0%.一代测序法和MGB荧光探针法在区分是否含有突变上的符合率为95.3%.结论 TaqMan-MGB荧光探针法可快速、敏感地检测患者胃黏膜标本中幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子的突变情况,与药敏试验和一代测序法有较高的符合性.
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作者：
作者单位：
生物芯片上海国家工程研究中心, 上海,201203
[1]
中国食品药品检定研究院体外诊断试剂检定所, 北京,100050
[2]
201203 上海,生物芯片上海国家工程研究中心;200438 上海,复旦大学生命科学学院
[3]
100034,北京大学第一医院消化内科
[4]
201203 上海,生物芯片上海国家工程研究中心;200092 上海,同济大学医学院消化疾病研究所
[5]
期刊：
《中国医药生物技术》2017年12卷4期 325-329页
ISTIC
栏目名称：
论著
DOI：
10.3969/j.issn.1673-713X.2017.04.006
发布时间：
2017-08-24
基金项目：
2015 年浦东新区科技发展基金
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