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基于网络药理学、分子对接和生物信息学对中药复方抑制COVID-19"细胞因子风暴"分子机制的探索与验证

Exploration and verification of molecular mechanism of traditional Chinese medicine prescriptions in inhibi-ting COVID-19"cytokine storm"based upon network pharmacology,molecular docking and bioinformatics

摘要目的:以确定临床疗效的6种推荐中药复方为研究对象,探索中药治疗COVID-19的分子机制和物质基础.方法:利用TCMSP、IMMPORT、OMIM等数据库获得治疗COVID-19的免疫靶点.Cytoscape3.4.0用于构建"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络以及网络拓扑学分析,随后进行PPI、G()功能和KEGG通路富集分析.AutoDock Vina用于分子对接.SsG-SEA利用转录组和microarray数据计算免疫细胞浸润程度.结果:对"免疫靶点-中药-化合物-疾病"网络进行拓扑学分析,本研究发现28种COVID-19免疫靶点高度关联化合物,对其进行分子对接发现豆甾醇、靛玉红、黄芩素等与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2,angiotensin converting enzyme Ⅱ)以及新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶具有较好的结合活性.6种复方均通过TNF、IL-17等信号通路发挥抗炎、调节细胞因子活性.IL-6是6种复方抗COVID-19的共同核心免疫靶标.肺组织表达谱生物信息学分析证实IL-6的表达与活化CD8+T细胞、调节T细胞等免疫细胞的浸润高度有关,是免疫反应的关键分子.结论:中药复方的活性化合物豆甾醇、靛玉红、黄芩素等作用于IL-6、IL-10、IL-1B等免疫靶点调节TNF、IL-17等多条信号通路,从而发挥抑制COVID-19"细胞因子风暴"的作用.

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DOI 10.13286/j.1001-5213.2021.02.02
发布时间 2021-03-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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